2014年研究スタート [研究]
ハゼ亜目魚類の多様化プロセスを知るために，系統樹作成の次のステップは分岐年代推定です．今日は，その年代較正のポイントとなる論文をもう一度整理しなおしましたが，やはりあまりないようです．
みなさま，いい情報があれば是非お教え下さいｗ
以下，メモ書き．
1. 始新世のモンテボルカからハゼ科化石： 50 MYA（5000万年前）．
Bellwood DR (1996) The eocene Wshes of Monte Bolca: the earliest coral reef Wsh assemblage. Coral Reefs, 15:11–19
2. 最も古いハゼ科耳石化石（インド産）：51–56 MYA．
Bajpai S, Kapur V (2004) Oldest known gobiids from Vastan Lignite Mine (early Eocene), Surat District, Gujarat. Current Science, 87:433–435
3. フランス産ノコギリハゼ科化石： 23–24 MYA．
Gierl C., Reichenbacher B., Gaudant J., Erpenbeck D., Pharisat A (2013) An extraordinary gobioid fish fossil from southern France. PLoS ONE 8, e64117.
4. 魚類全体の分子系統におけるハゼ亜目魚類のドンコ科クレード（ツバサハゼ科を含む）とその他全ハゼ類との分岐年代推定値：72.8 (92.8-52.8) MYA．
Betancur-R R, Broughton RE, Wiley EO, Carpenter K, Lopez JA, Li C, Holcroft NI, Arcila D, Sanciangco M, Cureton J, Zhang F, Buser T, Campbell M, Rowley T, Ballesteros JA, Lu G, Grande T, Arratia G, Ortí G (2013) The tree of life and a new classification of bony fishes. PLoS Currents Tree of Life. 2013 Apr 18.
5. 魚類全体の分子系統におけるハゼ亜目魚類のカワアナゴ科とその他（ツバサハゼ科とドンコ科を除く）全ハゼ類のクレードとの分岐年代推定値：55.4 (44.6-65.7) MYA．
Near TJ, Dornburg A, Eytan RI, Keck BP, Smith WL, Kuhn KL, Moore JA, Price SA, Burbrink FT, Friedman M, Wainwright PC (2013) Phylogeny and tempo of diversification in the superradiation of spiny-rayed fishes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109:13698–13703.
明日？は，この数値を使って，mcmctreeソフトウェアを使って，実際に分岐年代推定をしてみたいと思います．
みなさま，いい情報があれば是非お教え下さいｗ
以下，メモ書き．
1. 始新世のモンテボルカからハゼ科化石： 50 MYA（5000万年前）．
Bellwood DR (1996) The eocene Wshes of Monte Bolca: the earliest coral reef Wsh assemblage. Coral Reefs, 15:11–19
2. 最も古いハゼ科耳石化石（インド産）：51–56 MYA．
Bajpai S, Kapur V (2004) Oldest known gobiids from Vastan Lignite Mine (early Eocene), Surat District, Gujarat. Current Science, 87:433–435
3. フランス産ノコギリハゼ科化石： 23–24 MYA．
Gierl C., Reichenbacher B., Gaudant J., Erpenbeck D., Pharisat A (2013) An extraordinary gobioid fish fossil from southern France. PLoS ONE 8, e64117.
4. 魚類全体の分子系統におけるハゼ亜目魚類のドンコ科クレード（ツバサハゼ科を含む）とその他全ハゼ類との分岐年代推定値：72.8 (92.8-52.8) MYA．
Betancur-R R, Broughton RE, Wiley EO, Carpenter K, Lopez JA, Li C, Holcroft NI, Arcila D, Sanciangco M, Cureton J, Zhang F, Buser T, Campbell M, Rowley T, Ballesteros JA, Lu G, Grande T, Arratia G, Ortí G (2013) The tree of life and a new classification of bony fishes. PLoS Currents Tree of Life. 2013 Apr 18.
5. 魚類全体の分子系統におけるハゼ亜目魚類のカワアナゴ科とその他（ツバサハゼ科とドンコ科を除く）全ハゼ類のクレードとの分岐年代推定値：55.4 (44.6-65.7) MYA．
Near TJ, Dornburg A, Eytan RI, Keck BP, Smith WL, Kuhn KL, Moore JA, Price SA, Burbrink FT, Friedman M, Wainwright PC (2013) Phylogeny and tempo of diversification in the superradiation of spiny-rayed fishes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109:13698–13703.
明日？は，この数値を使って，mcmctreeソフトウェアを使って，実際に分岐年代推定をしてみたいと思います．
コメント 0